由于微波具有加热迅速、均匀（具有选择性加热）、节能高效（比远红外线节能1/3-1/2）、防霉保鲜（能最大限度的保存物料的活性和食品中的维生素、色泽和营养成分）、可连续生产、安全无害、设备占地面积小、改善劳动条件等优点，已被广泛应引用于粉状、颗粒、片状等各种食品、营养品、调味品、休闲食品、农副产品、鱼虾片、海鲜片、肉脯、豆制品、方便面、速食品、干果、茶叶、卡拉胶粉、果蔬的干燥、杀菌。也适用于液体饮料、营养品、中草药的萃取和液体杀菌。
一、微波加热机理：
微波具有一定的能量（电磁场能）。在一定的条件下，它作为一直工能源予以应用，微波对物料的作用有物理、化学、生物等效应，可用于各种目的，但应用最广泛的是微波加热。
微波加热是极高频率的电磁振荡作用于具有电极性的物料分子，使其分子排列趋向剧烈变化，而产生激烈的类似于“摩擦”的效果。使物体变热。此过程即微波的电磁场能量转化为热能。水分子是极性分子，强烈吸收微波。含有水分的物料在受到足够的微波辐射时，其中的水分子吸收微波很快的升温蒸发，物料得以迅速干燥。
微波杀菌是微波的热效应和生物效应共同作用的结果。微波对细菌的热效应是使蛋白质变性，使细菌失去营养、繁殖和生存的条件而死亡；生物效应是微波电磁场改变细胞膜断面的电位分布，影响细胞周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细胞因此营养不良，不能正常新陈代谢，细胞结构功能紊乱，生长发育受到抑制而死亡。此外，决定细胞正常生长和稳定遗传繁殖的核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）是由若干氢键紧密连接而成的卷曲形大分子。足够强的微波场可以导致氢键松弛、断裂和重组， 从而诱发遗传基因突变，或染色体畸变，甚至断裂。微波灭菌正是利用了电磁场的热效应和生物效应对生物的破坏作用，因此，微波杀菌温度低于常规方法，仅要70-105℃，时间仅约需3-5分钟。
1.肉类制品的微波干燥杀菌
各熟食厂家生产的各熟食店柜台上摆放的诸如：五香猪蹄、动物的???熟食、火腿、西式红肠、各类酱卤肉、鸡肉、鸭肉等等；其保鲜期均十分短、一般最长也不超过三天就腐烂了。如果采用微波对其杀菌保鲜后，其鲜美度、嫩度、风味均保持原味，保鲜期可达到3个月以上，已广泛应用于牛肉干、猪肉脯、鱼片、等肉制品的干燥、杀菌、保鲜，其中牛肉干可达6个月以上。
2.蔬菜的微波杀菌保鲜
山野菜被通常称为绿色食品，而深受国内外用户的欢迎。但其保鲜期受到大大影响，例如：生长在苏皖两地的苔菜，是一种贡菜，具有悠久的历史，均以半成品销售。后来采用高温高压等传统的巴氏灭菌方法，虽然能达到一定的杀菌效果，但苔菜的脆度受到破坏疲软，严重影响到.产品的质量，限制了扩大生产，不利于外销。采用微波杀菌技术以后，其杀菌温度仅需80度左右，完全达到商业无菌效果，保鲜期可长达9个月以上，其风味、脆度等各项口感指标均满足销售需求。
微波是一种频率极高的电磁波,其频率范围在300MHZ-300GMHZ,微波技术是上世纪中叶兴起的无线电技术,它首先被广泛应用于无线电通讯、广播、电视、导航、遥撼、遥测、雷达等领域。近些年来，它又作为一种能源在经济建设和人们时常生活中得到了日益广泛的运用，如家用微波炉早已进入千家万户，作为一种工业加工手段，它首先在食品工业中得到了应用，主要用于干燥、杀菌、焙烤、熟化、膨化、调温解冻、酵化、催熟等，有利地促进了食品工业发展。随着经济和科学技术的发展，微波能技术将在食品工业中得到更广泛的应用。